南加大是私立大學，由監理會管理，由約50名投票所產生的理事與幾名常務理事、榮譽理事和不投票的退休理事所組成的。監理會投票成員五年一任，每年改選五分之一的席次，只有不參選的理事可以投票。理事多半由是大型組織（包括國內和國際）的高級主管、杰出校友以及大學管理高層或三者結合組成。大學行政系統包含一位校長、監理事、數位負責不同部門的副校長、一位財務主管、資訊總監和體育指導員。現任校長為C.L. Max Nikias。文理科學學院、研究所、18個專業學校分別各由一位學院院長負責。南加大有時會授予榮譽退職頭銜給先前的行政長官，有6位榮譽退職的行政長官。南加大擁有曾被評為全美國排名第一的電影學院、全美國排名第一的老齡學院、全美國排名第三的公共政策學院、全美國排名的第十的工程學院。
南加州大學是一所綜合性的大學，共有22個專業學院分別為：
Cinematic Arts電影藝術學院
Annenberg傳播學院
Marshall馬歇爾商學院
Dana and David Dornsife文理學院
Leventhal會計學院
建筑學院
Roski藝術學院
Viterbi 工程學院
Jimmy Iovine and Andre Young創新學院
Glorya Kaufman舞蹈學院
Herman Ostrow牙醫學院
Rossier教育學院
戲劇學院
Gould法學院
Keck醫學院
Sol Price公共政策學院
Leonard Davis 老齡科學學院
Thornton音樂學院
職業科學與職業治療學院
社會工作學院
生物運動機能與物理治療學院
Glorya Kaufman舞蹈學院