增值稅專用發票，農副產品收購發票，海關專用增值稅繳款書，免稅的農副產品銷售發票。增值稅扣稅憑證，包括增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書、農產品收購發票和農產品銷售發票、運輸費用結算單據，以及使用稅控系統開具的機動車銷售統一發票。
增值稅扣稅憑證是增值稅抵扣的合法、有效憑據，增值稅扣稅憑證有五類，具體包括增值稅專用發票、海關進口增值稅專用繳款書、農產品收購發票、農產品銷售發票和稅收繳款憑證等：
增值稅專用發票。增值稅專用發票從銷售方或者提供勞務或服務方取得的增值稅專用發票，含貨物運輸業增值稅專用發票、稅控機動車銷售統一發票。另外還包括小規模納稅人從稅務機關代開的增值稅專用發票。增值稅抵扣依據為增值稅專用發票上注明的增值稅額。 海關進口增值稅專用繳款書。即從海關取得的海關進口增值稅專用繳款書。抵扣依據為進口增值稅專用繳款書上注明的增值稅額。對海關代征進口環節增值稅開具的增值稅專用繳款書上標明有兩個單位名稱的，即既有代理進口單位名稱，又有委托進口單位名稱，只準取得專用繳款書原件的單位抵扣稅款。申報抵扣稅款的委托進口單位，必須提供相應的海關代征增值稅繳款書原件、委托代理合同及付款憑證，否則，不予抵扣進項稅。 農產品收購發票。即納稅人直接向農業生產者收購農副產品開具的收購發票。增值稅抵扣依據按照農產品收購發票金額和13%的扣除率計算的進項稅額。計算公式為：進項稅額=＝買價×扣除率。買價，是指納稅人購進農產品在農產品收購發票上注明的價款。“自行開具、自行抵扣”必須是農業生產者銷售的自產農業產品。
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