根據《印花稅暫行條例施行細則》第十條規定，印花稅只對稅目稅率表中列舉的憑證和經財政部確定征稅的其他憑證征稅。根據國稅地字[1988]37號第二條規定，機動車輛保險屬于《印花稅暫行條例》第二條列舉的財產保險合同。

　　故，貴司與保險公司簽訂的機動車保險合同應按“財產保險合同”稅目繳納印花稅。

　　又根據國稅函發[1990]428號規定，對印花稅暫行條例中列舉征稅的各類保險合同，其計稅依據由投保金額改為保險費收入，適用稅率變為千分之一。

　　綜上，貴司簽訂的機動車保險合同需要按照“財產保險合同”項目，適用千分之一稅率繳納印花稅，其中計稅依據不包含保險公司代收的車船稅的金額。

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　　相關規定：

　　《印花稅暫行條例》

　　第二條下列憑證為應納稅憑證：

　　1.購銷、加工承攬、建設工程承包、財產租賃、貨物運輸、倉儲保管、借款、財產保險、技術合同或者具有合同性質的憑證；

　　《國家稅務局關于對保險公司征收印花稅有關問題的通知》（國稅地字[1988]37號）

　　二、關于財產保險合同的貼花問題。

　　目前，保險公司的財產保險分為企業財產保險、機動車輛保險、貨物運輸保險，家庭財產保險和農牧業保險五大類。為了支持農村保險事業的發展，照顧農牧業生產的負擔，除對農林作物、牧業畜類保險合同暫不貼花外，對其他幾類財產保險合同均應按照規定計稅貼花。其中，家庭財產保險由單位集體辦理的，均按確定的個人投保金額計稅。對其他幾類財產保險合同均應按照規定計稅貼花。其中，家庭財產保險由單位集體辦理的，均按確定的個人投保金額計稅。

　　《國家稅務總局關于改變保險合同印花稅計稅辦法的通知》（國稅函發[1990]428號）

　　一、對印花稅暫行條例中列舉征稅的各類保險合同，其計稅依據由投保金額改為保險費收入。

　　二、計算征收的適用稅率，由萬分之零點三改為千分之一。