審計署的主要職責是：
（一）主管全國審計工作。負責對國家財政收支和法律法規規定屬于審計監督范圍的財務收支的真實、合法和效益進行審計監督，維護國家財政經濟秩序，提高財政資金使用效益，促進廉政建設，保障國民經濟和社會健康發展。對審計、專項審計調查和核查社會審計機構相關審計報告的結果承擔責任，并負有督促被審計單位整改的責任。
（二）起草審計法律法規草案，擬訂審計政策，制定審計規章、審計準則和指南并監督執行。制定并組織實施審計工作發展規劃和專業領域審計工作規劃，制定并組織實施年度審計計劃。參與起草財政經濟及其相關的法律法規草案。對直接審計、調查和核查的事項依法進行審計評價，做出審計決定或提出審計建議。
（三）向國務院總理提出年度中央預算執行和其他財政收支情況的審計結果報告。受國務院委托向全國人大常委會提出中央預算執行和其他財政收支情況的審計工作報告、審計發現問題的糾正和處理結果報告。向國務院報告對其他事項的審計和專項審計調查情況及結果。依法向社會公布審計結果。向國務院有關部門和省級人民政府通報審計情況和審計結果。
（四）直接審計下列事項，出具審計報告，在法定職權范圍內做出審計決定或向有關主管機關提出處理處罰的建議：
1．中央預算執行情況和其他財政收支，中央各部門（含直屬單位）預算的執行情況、決算和其他財政收支。
2．省級人民政府預算的執行情況、決算和其他財政收支，中央財政轉移支付資金。
3．使用中央財政資金的事業單位和社會團體的財務收支。
4．中央投資和以中央投資為主的建設項目的預算執行情況和決算。
5．中國人民銀行、國家外匯管理局的財務收支，中央國有企業和金融機構、國務院規定的中央國有資本占控股或主導地位的企業和金融機構的資產、負債和損益。
6．國務院部門、省級人民政府管理和其他單位受國務院及其部門委托管理的社會保障基金、社會捐贈資金及其他有關基金、資金的財務收支。
7．國際組織和外國政府援助、貸款項目的財務收支。
8．法律、行政法規規定應由審計署審計的其他事項。
