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新修訂的個人所得稅法和實施條例均自去年9月1日起開始施行。其中，對工資、薪金所得項目而言，是指納稅人9月1日（含）以后實際取得的工資、薪金所得，應適用稅法修改后的減除費用標準3500元和七級超額累進稅率表，計算繳納個人所得稅。而納稅人9月1日前實際取得的工資、薪金所得，無論稅款是否在9月1日以后申報入庫，均應適用稅法修改前的減除費用標準和稅率表，計算繳納個人所得稅。即根據《國家稅務總局關于調整個人取得全年一次性獎金等計算征收個人所得稅方法問題的通知》（國稅發[2005]9號）文件中規定的計征辦法，計算納稅人年終一次性獎金應納個人所得稅，應按實際取得所得的時間判斷是否采用七級超額累進稅率表。
國稅發[2005]9號文件規定，納稅人取得全年一次性獎金，單獨作為一個月工資、薪金所得計算納稅，并按以下計稅辦法，由扣繳義務人發放時代扣代繳：先將雇員當月內取得的全年一次性獎金，除以12個月，按其商數確定適用稅率和速算扣除數。
如果在發放年終一次性獎金的當月，雇員當月工資薪金所得低于稅法規定的費用扣除額，應將全年一次性獎金減除“雇員當月工資薪金所得與費用扣除額的差額”后的余額，按上述辦法確定全年一次性獎金的適用稅率和速算扣除數。
將雇員個人當月內取得的全年一次性獎金，按前述規定確定的適用稅率和速算扣除數計算征稅。
1.如果雇員當月工資薪金所得高于（或等于）稅法規定的費用扣除額的，適用公式為：應納稅額=雇員當月取得全年一次性獎金×適用稅率-速算扣除數2.如果雇員當月工資薪金所得低于稅法規定的費用扣除額的，適用公式為：應納稅額=（雇員當月取得全年一次性獎金-雇員當月工資薪金所得與費用扣除額的差額）×適用稅率-速算扣除數上述全年一次性獎金是指行政機關、企事業單位等扣繳義務人，根據其全年經濟效益和對雇員全年工作業績的綜合考核情況，向雇員發放的一次性獎金。所謂一次性獎金也包括年終加薪、實行年薪制和績效工資辦法的單位根據考核情況兌現的年薪和績效工資。
由于此次個人所得稅法修改后，年終一次性獎金適用的稅率表發生了變化，因此，在計算年終一次性獎金納稅時，同樣一筆年終一次性獎金，所納稅額也將發生變化。
案例1：王某2011年12月的工資收入為5000元，當月取得年終一次性獎金24000元，其年終獎金應納稅額的計算如下：根據規定，王某12月當月工資薪金所得高于（或等于）稅法規定的費用扣除額，適用公式：應納稅額=雇員當月取得全年一次性獎金×適用稅率-速算扣除數。先將王某12月份取得的全年一次性獎金，除以12個月，按其商數確定適用稅率和速算扣除數，則24000÷12=2000（元）。用2000元查新的七級超額累進稅率表可知，其適用稅率為10%，速算扣除數為105。
那么，王某的年終獎應納稅額為24000×10%－105=2295（元）
案例2：張女士2011年12月收入為2500元，由于當月工資不足3500元，當月不用繳稅。當月取得的年終一次性獎金36000元需要繳稅。根據規定，首先要用36000元補足工資與費用扣除免征額之間的差額1000元，再用剩余的35000元除以12個月，其商數為2916.67元，查找新的七級超額累進稅率表可知，其對應的稅率和速算扣除數分別為10%和105.那么，張女士的年終一次性獎及應納稅額為：（36000-1000）×10%－105=3395（元）。
綜上所述，對于依照新的稅法文件計算年終一次性獎金納稅時應注意以下情況：1.在一個納稅年度內，對每一個納稅人，這種計稅辦法只允許采用一次。
2.雇員取得的除全年一次性獎金以外的其他各種名目的獎金，如半年獎、季度獎、加班獎、先進獎、考勤獎等，一律與當月工資、薪金收入合并，計算繳納個人所得稅。
3.稅率與速算扣除數做了調整，在計算一次性獎金時應依照發放時間來確定適用新稅率還是舊稅率。凡是9月1日以后發放的一次性獎金，均依照7級稅率來執行，不分段計算。
4.對于發放不含稅全年一次性獎金收入個人所得稅的計算方法，除在稅率與發放時間上加以注意外，仍依照原計算辦法執行。
企業年金算法也有調整
國家稅務總局公告2011年第9號《國家稅務總局關于企業年金個人所得稅有關問題補充規定的公告》，該公告自2011年1月30日起執行，該公告生效之后取得的所得按照以下算法進行計稅：當月工資所得+企業繳費額≦費用扣除標準的，應納稅所得額為0.當月工資所得<費用扣除標準，但當月工資薪金所得+企業繳費額>；費用扣除標準的，其超過部分按原公式進行計稅（即應納稅所得額為工資薪金所得+企業繳費額-費用扣除標準）。當月工資薪金所得>費用扣除標準的，仍按原公式計稅（應納稅所得額為企業繳費額）。
對于以前年度企業繳費部分未扣繳稅款補稅，按年進行補繳。
納稅年度內每一職工應補繳稅款=當年企業未扣繳稅款的企業繳費合計數×適用稅率－速算扣除數。
其中適用稅率根據每一職工月平均工資額減去費用扣除標準后的差額確定，如計算結果如小于0，適用稅率調整為5%。
職工月平均工資額=當年企業為每一職工據以計算繳納年金費用的工資合計數÷企業實際繳納年金費用的月份數，上式工資合計數不包括未計提企業年金的獎金、津補貼等。
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