國債利息收入，是指企業持有國務院財政部門發行的國債取得的利息收入。應以國債發行時約定應付利息的日期，確認利息收入的實現。做會計分錄的時候，國債利息收入應該計入投資收益。 會計分錄如下：
借：銀行存款
貸：投資收益——國債利息收入。
根據企業所得法二十六條的規定，企業取得的國債利息收入，免征企業所得稅。
但是如果是轉讓國債的收入，要征收企業所得稅。 對國債利息收入免征企業所得稅是一項已執行多年的政策，1992年國務院發布的《中華人民共和國國庫券條例》(國務院令第95 號)第十二條規定，國庫券的利息收入享受免稅待遇。現行內資《企業所得稅暫行條例實施細則》第二十一條也規定:"納稅人購買國債的利息收入，不計入應納稅所得額。"
從世界各國的情況來看，對國債的利息收入免稅也是一項通行的做法，這主要是由于國債的利息完全是由國家財政資金支付的，如果對其征稅，一方面相當于對國家財政支付的利息通過征收所得稅的方式再收回一部分，沒有什么實際意義;另一方面將減少國債購買者最終得到的利息收入，不利于鼓勵企業購買國債。而且企業購買國債在取得利息收入的同時基本上沒有對應的成本費用支出，因此對國債利息收入免稅也不違背收入和成本費用的配比原則。因此，本法保留了這一政策，在第二十六條第一項中規定國債利息收入為免稅收入。
值得注意的是，本法雖規定國債利息收入為免稅收入，但并不意味著與國債有關的收入都可以免稅，對于國債持有者在二級市場轉讓國債獲得的收入，還是應當作為轉讓財產收入計算繳納企業所得稅。
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