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2012年的稅務檢查重點和2011年的框架是相同的，但內容上有變化。這也說明我國稅務檢查項目相對比較穩定，對重點行業的認定也比較清晰。從已經下發的《國家稅務總局關于開展2012年稅收專項檢查工作的通知》（國稅發[2012]17號）來看，2012年稅務檢查重點和納稅人的權益息息相關，依然圍繞“指令性檢查、指導性檢查、重大稅收違法案件的檢查、組織開展區域專項整治、對重點稅源企業進行輪查和嚴厲打擊發票違法犯罪活動”六個方面展開。
一、指令性檢查
指令性檢查是指所有省份都要按照總局的要求必查的項目。2012年的指令性檢查項目主要包括接受成品油增值稅專用發票的企業；資本交易項目；辦理電子、服裝、家具類產品出口退（免）稅的企業及承接出口貨物業務的貨代公司。
（一）接受成品油增值稅專用發票的企業。
這類企業今年之所以成為頭號檢查目標，是因為，2011年以來，全國范圍特別是河北、內蒙古等地開展了針對煤炭經銷企業、礦產品經銷企業接受成品油增值稅專用發票，尤其是企業接受柴油增值稅專用發票虛開的專項檢查，發現了很多問題，引起了國家稅務總局的特別關注。因此，今年才會在全國推廣該項檢查。值得注意的是，今年該項檢查不但是國家稅務總局的專項檢查重點，也是公安部涉稅案件查辦的重點。
虛開發票一直就是稅務機關檢查的重點。對外虛開發票的企業，首先要解決的就是進項的問題。從取得進項的來源看，主要包括兩類，一是享受稅收優惠企業虛開的發票。這類企業由于享受稅收優惠，上游企業不繳增值稅的情況下還可以開具用于抵扣的專用發票，而下游企業可以用來抵扣。最典型的就是農產品加工企業，這些企業的進項來源是農產品收購發票，而農民銷售自產農產品屬于免稅項目，因此，農產品加工企業自己開具農產品收購發票，既不需要繳稅又可以取得充足的進項稅用于抵扣。二是“票貨分離”導致的虛開發票。“票貨分離”產生的虛開行為的典型特點就是有中介人牽線，需要發票但沒有實際購進貨物的企業拿走發票，貨物被實際用貨的企業拉走，中介人則從中收取一定的手續費，這就產生了“票貨分離”的現象。除了“票貨分離”，“無貨虛開”也是虛開發票的一種，但最為厲害的還是“票貨分離”。這是因為，用于虛開的貨物一定是大多數企業都需要的，而柴油、汽油之類的成品油恰恰就是這類“萬能貨物”。因此接受成品油增值稅專用發票的企業就成為今年的稽查重點。這里面的重點又是運輸企業常用的柴油。
那么，對于此類企業的檢查，稅務機關將會關注哪些要素呢，筆者認為，主要應關注以下幾個方面：
1、資金流檢查
資金流是任何企業都無法磨滅的證據，因此，對于現金流的檢查，必然會成為稅務機關檢查的重中之重。以接受成品油增值稅專用發票最嚴重的煤炭經銷企業為例。2009年以后，煤炭經銷增值稅稅率提高到了17%，但由于目前整個煤炭市場為“賣方市場”，買方沒有話語權。煤炭生產企業不給發票，煤炭經銷企業的下游企業多是大型發電廠，必須要票，這就造成“買煤的拿不到增值稅專用發票，賣煤的沒有增值稅專用發票又賣不成”的現象。因此，為了解決自身的進項問題，煤炭經銷企業往往就會接受虛開發票。
然而，市場上的煤炭增值稅專用發票一是少，二是價格高，煤炭經銷企業很難取得。所以這類企業就退而求其次，購買相對比較容易買到柴油增值稅專用發票。
煤炭經銷企業購進油品從邏輯上是沒問題的，因為煤炭運銷需要車輛和柴油也是事實。但在實際操作中，煤炭經銷企業多采用一次性包干給運輸車輛，由司機在運輸途中自行加油。因此，煤炭經銷企業基本上不存在自己買柴油儲存，進行運輸的情形。
一般而言，企業虛開增值發票主要有“有貨虛開”和“無貨虛開”，在實踐中又以“有貨虛開”最為常見。而煤炭企業接受柴油發票實質上就屬于“有貨虛開”。因為石油公司的確是有貨（柴油）銷售，但不是銷售給煤炭經銷企業，而實際的購油人往往是一些民營和個體的加油站，這些加油站由于其下游的消費者不要發票，自己可以偷稅，所以買柴油也可以不要發票。于是，實際購油人不要票，而煤炭經銷企業是只要發票不要貨，這兩者通過中介人有機地結合起來。
需要提醒的是，過去，稅務稽查中對此類案件的取證往往會看票款的付款方向是否一致，但由于目前石油公司的發票管理加強，保證了票流和資金流的一致性。因此，目前，煤炭經銷企業取得虛開成品油專用發票的特征主要有兩步。*9步，中介人將購油資金利用網銀打入煤炭經銷企業賬戶，煤炭經銷企業以借款形式入賬，借：銀行存款，貸：其他應付款××人。第二步，煤炭經銷企業會在2分鐘之內，一分不差地將油款打入石油公司賬戶，這就使得票款一致，然后煤炭經銷企業出具委托書，委托這些實際購油人，也就是私人的加油站把油取走，發票留給煤炭經銷企業，手續費另行支付。
煤炭經銷企業接受虛開柴油增值稅專用發票資金流的運轉主要有單向資金流向和雙向資金流向兩類。
單向資金流動：先扣手續費，后取發票。比如，某用油企業要購買1170萬元的柴油，油款1000萬元，進項稅170萬元。如果該企業直接向石油公司買油，但自己又不需要發票，于是就由中介人聯系煤炭經銷企業購買其發票所有權。聯系好以后，用油企業先扣4%的手續費，即40萬元，到中介人處為1130萬元，中介人再扣4%的手續費，然后將剩余的1090萬元交煤炭經銷企業業務員。業務員收到錢后，扣下自己2%的好處費，即20萬元，最終將1070萬元通過網銀打到煤炭企業的基本賬戶，此時，煤炭經銷企業做賬：“借：銀行存款，貸：其他應付款××業務員。”然后煤炭經銷企業在將其中的差額補足，最終將1170萬元打給石油公司。石油公司就可以開具專用發票給煤炭經銷企業。盡管煤炭經銷企業補了100萬元的差價，但是其取得的專用發票可以抵扣170萬元的稅款，就會有70萬元的收益。根據這一特點，稅務機關就會通過分析銀行對賬單而查出相應的問題。
全額支付，手續費事后結算。雙向資金流動和單向資金流動類似，所不同的是，其資金流都是全額流動，待石油公司出具發票后，由中介人拿著發票去煤炭經銷企業，一手給票，一手交相應的手續費。
2、運輸流檢查
柴油屬于特殊商品，必須有專用設備儲存和運輸。而且運輸柴油必須是在消防部門備案的油罐車。因此，判斷一個企業的用油量是否真實，稅務機關往往會從運輸流的各個環節入手進行檢查。主要的檢查方式包括，核查企業賬目，確定賬簿中有無油罐車固定資產，如果是租用車輛，有沒有租賃費用的發生，如雇傭了司機，有沒有詳細的聯系方式等。
除上述檢查方式外，稅務機關可能還會檢查油品儲存狀況、油品耗用情況、耗用柴油的設備是否屬實、購買柴油的細節等。
實際上，打擊成品油虛開增稅發票違法犯罪活動僅是稅務檢查的一個方面，今后稅務機關可能會繼續關注一些類似柴油的“萬金油”產品的增值稅發票虛開現象。
（二）資本交易項目
隨著我國經濟形勢的變化，中國的資本交易也日益活躍，稅務機關對其的檢查力度也在加強。資本交易項目納入稅務檢查重點始于2011年，并被作為頭號檢查項目。今年，國家稅務總局繼續將其列入指令性檢查項目，不過，今年排在了第二位。這是因為，從全國來看，企業接受虛開成品油增值稅專用發票的情況更為嚴重。
資本交易作為稅務檢查的項目，起因就是“大小非”解禁。2005年之前，我國股票市場實行股權分置，一部分股票允許上市流通，
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