會計核算：
1.企業應按照國家財務會計制度要求，對研發支出進行會計處理；同時，對享受加計扣除的研發費用按研發項目設置輔助賬，準確歸集核算當年可加計扣除的各項研發費用實際發生額。企業在一個納稅年度內進行多項研發活動的，應按照不同研發項目分部歸集可加計扣除的研發費用。
2.企業應對研發費用和生產經營費用分別核算，準確、合理歸集各項費用支出，對劃分不清的，不得實行加計扣除。
注意事項：
1.新規定適用于會計核算健全、實行查賬征收并能夠準確歸集研發費用的居民企業。
2.企業研發費用各項目的實際發生額歸集不準確、匯總額計算不準確的，稅務機關有權對其稅前扣除額或加計扣除額進行合理調整。
3.稅務機關對企業享受加計扣除優惠的研發項目有異議的，可以轉請地市級（含）以上科技行政主管部門出具鑒定意見，科技部門應及時回復意見。企業承擔省部級（含）以上科研項目的，以及以前年度已鑒定的跨年度研發項目，不再需要鑒定。
4.企業符合規定的研發費用加計扣除條件而在2016年1月1日以后未及時享受該項稅收優惠的，科研追溯享受并履行備案手續，追溯期限最長為3年。
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