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企業在生產、經營過程中，一般都有可能會不定期接受稅務檢查。而稅務檢查涉及的程序繁多，很多企業不知道如何在檢查中正確維護自己的合法權益，這很可能給企業造成不利影響。因此，在接受稅務檢查時，企業應善于維護自己享有的合法權益，避免稅務危機的發生。具體來說，企業應當著重從如下八個方面來維護自己的合法權益。
*9，審查稅務檢查的合法性。稅務機關在檢查之前，應向企業下達規范的《稅務檢查通知書》，檢查須由兩名以上檢查人員共同實施，并向被查對象出示稅務檢查證。因此，如果檢查人員沒有依法下達《稅務檢查通知書》，或者沒有出示稅務檢查證，企業可以拒絕檢查，以防止個別人員濫用檢查權力，侵害企業的利益。
第二，如果被查企業與檢查人員存在利害關系，被查企業可以要求相關檢查人員回避。如果有利害關系的檢查人員沒有回避，并且檢查人員存在濫用職權、故意打擊報復的行為，給被查企業造成了損失，被查企業可以收集相關證據，以備將來依法行使陳述申辯、聽證、復議和訴訟的權利，維護自己的合法權益。
第三，要求檢查人員為企業的商業秘密、個人隱私保密。在檢查的過程中，稅務檢查人員可能會掌握到企業的客戶信息、購銷合同、盈利能力、負債情況、專利技術、生產工藝、工資情況等信息，其中有些屬于企業保密的范疇，企業應當要求檢查人員對其保密。如果有證據表明檢查人員泄露企業的商業秘密或個人隱私，企業可以依法要求稅務機關賠償造成的損失。
第四，稅收征管法規定，稅務稽查人員調查取證時，不得違反法定程序搜集證據材料，不得以偷拍、偷錄、^***等手段獲取侵害他人合法權益的證據材料，不得以利誘、欺詐、脅迫、暴力等不正當手段獲取證據材料。在法律上，違法取得的證據不能作為定案依據，被查企業對涉及的違法事實可以不予認可。如果將來稅務機關依據這些證據進行處理、處罰，被查企業可以依法要求聽證、復議或訴訟，以避免給自己造成損失。
第五，認真審核《稅務檢查工作底稿》，慎重簽署企業意見。《稅務檢查工作底稿》是檢查人員對違法事實所涉及的業務情況和數據進行的描述，也是證據的組成部分。企業在《稅務檢查工作底稿》簽署意見之前，應先根據底稿上所涉及的業務和數據，查找企業相關的會計資料，認真核實，務求準確，然后再根據核對的情況簽署企業的真實意見。
第六，積極陳述申辯，盡早澄清事實，爭取減少損失。被查企業通常都是在收到《稅務行政處罰事項告知書》之后才進行陳述申辯，其實在稅務機關作出處罰決定之前，企業隨時都可以陳述申辯。不僅可以對擬處罰決定進行陳述申辯，也可以對擬處理決定進行陳述申辯。被查企業在陳述申辯的時候，如果對檢查人員認定的某項違法事實有異議，應當盡可能同時提供不同的證據和依據，爭取在將案件移交到審理環節之前就澄清事實，盡早避免錯案發生，減少經濟損失。
第七，被查企業除享有陳述申辯權利之外，對罰款還享有聽證、復議和訴訟的權利，對稅款和滯納金享有復議和訴訟的權利。企業行使這些權利都有時間上的限制，在被查企業相繼收到的《稅務行政處罰事項告知書》、《稅務處理決定書》和《稅務行政處罰決定書》上，都會告知行使相關權利的途徑、條件和期限。如果被查企業對其中的事項有異議，切記不要錯過行使相關權利的時間。
第八，被強制執行時要防止財產非正常損失。被查企業如果未按照規定的期限繳納或者解繳稅款，經責令限期繳納而逾期仍未繳納的；或者對罰款逾期不申請行政復議也不向人民法院起訴、又不履行的，稅務機關可能要依法采取強制執行措施。在這個過程中，被查企業雖然處于被強制執行的不利地位，但仍要關注自己的正當權益是否受到侵害。比如，企業被稅務機關扣繳的存款是否超過應納稅款、罰款和滯納金的總金額；稅務機關在對財產進行變現時是否按照法定的變現順序進行；拍賣或者變賣所得抵繳稅款、滯納金、罰款后的剩余部分是否退還被執行人等。
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